Pertama di Indonesia, 18 Prodi UIN Sunan Kalijaga Raih Akreditasi Internasional FIBAA, Berikut Daftarnya

2. Pendidikan Bahasa Arab (S1)

3. Pendidikan Agama Islam (S1)

4. Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (S1)

5. Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (S2)

6. Pendidikan Islam Anak Usia Dini (S1)

7. Pendidikan Islam Anak Usia Dini (S2)

8. Manajemen Pendidikan Islam (S1)

9. Ilmu Hadis (S1)

10. Studi Agama-agama (S1)