Bangunan museum ini merupakan salah satu bangunan tertua di Kota Tangerang dan Museum Tionghoa pertama di Indonesia.
Museum Benteng Heritage merupakan hasil restorasi bangunan berarsitektur tradisional Tionghoa yang diperkirakan dibangun pada pertengahan abad 17.
Keberadaannya menjadi cikal bakal pusat Kota Tangerang yang dahulu dikenal dengan nama Kota Benteng.
Museum Benteng Heritage, kata 'Benteng' pada nama museum ini terdapat kisah dan sejarah tersendiri.
Kata 'Benteng' berasal dari sebuah kisah dan sejarah pada masa penjajah Kolonial Belanda.
Saat itu penjajah Kolonial Belanda berhasil menguasai wilayah Kota Tangerang dan menjadikan kota ini sebagai markas pertahanan.
Markas Belanda ini sering diserang oleh kerajaan-kerajaan Banten, kerajaan-kerajaan tersebut ingin mengusir penjajah Kolonial Belanda agar hengkang dari bumi Nusantara.
Merasa posisinya terancam, penjajah Kolonial Belanda mendirikan sebuah Benteng Pertahanan.