3. Universitas Islam Indonesia
Perguruan tinggi swasta yang berada di Yogyakarta ini berdiri pada masa kemerdekaan yaitu 8 Juli 1945. Berawal dari nama Sekolah Tinggi Islam (STI).
Pendidikan STI merupakan hasil sidang umum majelis Sjoero Moeslimin Indonesia.
Beberapa tokoh nasional hadir dalam sidang ini, antaranya Bapak Muhammad Hatta, Muhammad Natsir, Muhammad Rum, hingga Kiai Haji Hasyim.
STI terus berkembang dari waktu ke waktu, sehingga dua tahun setelah merdeka Republik Indonesia pada tanggal 3 November 1947 STI resmi merubah nama menjadi Universitas Islam Indonesia.
4. Universitas Airlangga
Yang telah didirikan pada tahun 1954 tepatnya 10 November. Namun, cikal bakal Unair ini sudah ada sejak tahun 1847 melalui usulan pada pemerintah Hindia Belanda untuk mendirikan pusat pendidikan kesehatan di Jawa.
Karena pada masa itu butuh banyak tenaga kerja kesehatan, dan usulan tersebut ditindaklanjuti pada tahun 1849 dengan mendirikan Nederlandsch Indische Artsen School (NIAS) pada 1923.
Unair saat ini tidak hanya memiliki program studi Kedokteran saja, melainkan semua jurusan dari jenjang sarjana, magister, doktoral, bahkan vokasi pun ada dan saat ini sudah ada sekolah Internasionalnya.
5. Universitas Gadjah Mada