Sejak awal pandemi Covid-19 pada 2020, PT ASDP telah mengikuti aturan terkait penerapan protokol kesehatan secara ketat, mulai keberangkatan, dalam perjalanan, hingga kedatangan. Kebijakan penghentian layanan penyeberangan bagi penumpang pejalan kaki dan kendaraan di Pelabuhan Merak mulai diberlakukan pada 6 Mei 2021 atau H-7 hingga 17 Mei 2021 atau H+lebaran.***