Kebangkrutan tampaknya akan segera terjadi. Pada akhirnya, klub Boca Juniors diselamatkan oleh uang dari presiden Antonio Alegre dan wakilnya Carlos Heller, yang menginvestasikan uang mereka sendiri.
Setelah lebih dari sepuluh tahun tanpa gelar liga nasional, Boca Juniors akhirnya memenangkan Apertura pada 1992. Titik balik lainnya adalah kedatangan manajer baru scar Tabarez di 1993.
Boca Juniors memiliki tim yang kuat sekitar musim 2000-2001, mereka berada di puncak sepakbola Argentina dengan tiga gelar liga berturut-turut (1998-2000) dengan tim termasuk pemain seperti Juan Roman Riquelme, Marcelo Delgado dan Martin Palermo.
Puncaknya datang pada musim 2001-2002, dengan perolehan gelar treble pertama Boca Junior yang gemilang.
Baca Juga: Ukir Sejarah, Pesepakbola Putri Indonesia Direkrut Klub Italia, Roma CF
Selain Primera, Boca Juniors memenangkan Copa Libertadores dan Piala Interkontinental di musim-musim terbaiknya itu.
Pada akhirnya Boca Juniors adalah salah satu klub paling sukses di dunia jika melihat statistik dari Piala Interkontinental (federasi sepkbola Benua Amerika) yang telah memenangkan piala tiga kali.
Sebuah pencapaian yang hanya dilakukan oleh empat klub lain (AC Milan, Nacional, Penarol dan Real Madrid).***